A Szent Ferenc Sebei templom a Víziváros legrégebbi temploma, mely egy török mecset helyén épült. Az egykori Szent Erzsébet rend (Erzsébetiek) barokk temploma, az egykori építtetőkre emlékeztetve, ma is Assisi Szent Ferenc sebei tiszteletére van felszentelve.
Eredendően a ferences szerzeteseknek épült, de 1785-ben II. József császár a templomot a Szent Erzsébetről elnevezett apácarendnek adományozta.
A templom barokk stílusú belsejét XIX. századi festmények díszítik, köztük az egyiken az 1810-es tűzvészben keresztényeket menekítő Szent Flórián látható. A szószék még a ferencesek idejéből való.
A XIX. században a templom Batthyány tér irányába mutató szárnyait kórházzá és menedékházzá alakították át, és a Szent Erzsébet-apácák működtették. Ebben a templomban működik a budapesti német nyelvű hívek Szent Erzsébetről elnevezett lelkészsége.
